Phim Tiên Kiếm Kỳ Hiệp Truyện 3: Linh Châu Thần Kiếm kể về những lần chuyển kiếp của Phi Bồng - một vị tiên cảnh giữ tiên giới. Phim Tiên Kiếm Kỳ Hiệp Truyện 3: Linh Châu Thần Kiếm với những cảnh thần tiên khắc hoạ nên cảnh đẹp mờ ảo nơi tiên giới. Phim Tiên Kiếm Kỳ Hiệp Truyện 3: Linh Châu Thần Kiếm bắt đầu vào một hôm Trọng Lầu - một tên tôn ma xâm nhập vào tiên giới nhưng Phi Bồng không phát hiện được. Phi Bông đang trên dường chạy trốn sự truy bắt của binh lính thần giới thì bị rơi xuống trần gian. Phi Bồng chuyển kiếp thành Thục Sơn trấn yêu kiếm.

Trong khi đó Tịch Dao người yêu Phi Bồng vì muốn xuống trần gian tìm Phi Bồng nên đã dùng quả của Thần Thụ chế ra Tuyết Kiếm xâm nhập vào nhân gian. Phi Bồng lại chuyển kiếp thành thái tử Khương Quốc Long Dương tạo ra Ma Kiếm, nhưng sau chiến tranh Long Dương chết để lại Ma Kiếm. Lần luân hồi chuyển kiếp tiếp theo Phi Bồng trở thành một anh chàng có khả năng nhận biết đồ cổ - Cảnh Tiên, anh làm quản lý trong một cửa hàng đồ cổ. Lúc bấy giờ Cảnh Tiên là Thục Sơn Kiếm Tiên, sau khi anh tiềm được Ma kiếm thì gặp được Tuyết kiếm....